La visita al centro se completa con una serie de exposiciones. En el edificio de acogida, una exposición explica la vida en las marismas de Urdaibai y las aves migratorias. Dentro del recorrido, se encuentra el caserío Morgotaurre, un edificio del siglo XVII que ha sido rehabilitado como sede de la Fundación Xabier Maiztegi y que acoge además un reptilario y una exposición sobre huellas y rastros de animales.